Mỗi đơn vị Gia Đình Phật Tử sinh hoạt tại một ngôi chùa và mang tên ngôi chùa đó ( TD: GĐPT Tam Bảo, GĐPT Phật Quang…). Dưới đây là sơ đồ tổ chức 1 đơn vị GĐPT :
GIẢI THÍCH :
-Thầy Cố vấn giáo hạnh : thường là Thầy trụ trì ngôi chùa nơi GĐPT đang sinh hoạt. Thầy chịu trách nhiệm trước chánh quyền về sự sinh hoạt của đơn vị GĐPT ở chùa mình. Mọi sinh hoạt của Gia đình phải được sự đồng ý của Thầy. Thầy có trách nhiệm bảo trợ cho Gia đình và tạo mọi điều kiện giúp cho Gia đình phát triển cả về số lượng cũng như chất lượng.
-Gia trưởng : là một cư sĩ hoặc huynh trưởng GĐPT tuổi đời từ 30 trở lên, có đạo đức và uy tín, có lòng yêu tổ chức GĐPT, được Thầy trụ trì mời. Gia trưởng là người quyết định mọi việc trong Gia đình và chịu trách nhiệm trước Thầy trụ trì.
-Liên đoàn trưởng : là huynh trưởng GĐPT đã qua trại huấn luyện Huyền Trang (hoặc ít nhất cũng đã qua trại A Dục). Có năng lực và uy tín, được Gia trưởng mới. Liên đoàn trưởng có trách nhiệm điều hành ban huynh trưởng tổ chức thực hiện các mặt hoạt động của Gia đình. Liên đoàn trưởng chịu trách nhiệm trước Gia trưởng.
Phụ tá cho liên đoàn trưởng có 1 liên đoàn phó nam và 1 liên đoàn phó nữ
-Các đoàn trưởng : là huynh trưởng đã qua trại huấn luyện A Dục. Đoàn trưởng có trách nhiệm điều động đoàn sinh trong đoàn mình thực hiện các công việc do liên đoàn trưởng giao cho. Đoàn trưởng chịu trách nhiệm trước liên đoàn trưởng. Phụ tá cho đoàn trưởng có 1 hay 2 đoàn phó.
-Các đội, chúng trưởng và đầu đàn : là đoàn sinh đã qua trại huấn luyện đội chúng trưởng và đầu đàn. Đội, chúng trưởng và đầu đàn có nhiệm vụ dẫn dắt đội, chúng, đàn của mình thực hiện các công việc do đoàn trưởng giao. Đội, chúng trưởng và đầu đàn chịu trách nhiệm trước đoàn trưởng.